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╭Proteintech JAN 精選文獻引用回顧╯

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癌症,是現今醫療界努力想克服的難題。癌症病人死亡的主因,通常是因為癌細胞轉移,造成肺部浸潤及多重器官的衰竭。常見的轉移標的器官包含有腦、肺、肝、腎及骨髓等處,但目前對於各類癌症轉移的位置,仍沒有一個決定性的答案。該團隊搜集了 500 種人類癌細胞株,分別屬於 21 種癌症,並將其移植到小鼠體內,再進一步量化、統計,去分析各類癌細胞是否有偏好的轉移標的。根據統計結果,他們發現癌細胞的轉移並非隨機,各類癌細胞株有相對偏好的轉移標的,以及具有不同的轉移能力。該團隊表示,此癌症轉移地圖(metastasis map)未來將可作為臨床癌症治療以及相關研究的參考。


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不同的病毒有不同的方式去避免被免疫系統清除,而為了能清除病毒的感染,科學家們也付出了許多努力去研究病毒感染的機制,以找出有效對抗病毒感染的方法。本篇研究團隊以長片段非編碼 RNA(long non-coding RNA,lncRNA)作為研究方向,並以在病毒感染時,巨噬細胞內的表現量會下降的 lncRNA,為主要研究對象。根據篩選結果,發現其中的 lncRNA-GM 這段 RNA 可以促進第一型干擾素(Type I interferon,IFN-I)產生並抑制病毒複製。同時在小鼠實驗中也發現,當 缺乏 lncRNA-GM 時,該小鼠會更容易被病毒感染,且 IFN-I 的產量也會減少。接下來作者們近一步去探討背後的機制,發現 lncRNA-GM 會跟谷胱甘肽 S-轉移酶 Mu 1(Glutathione S-transferase M1,GSTM1)結合,抑制 GSTM1 和 TBK1 的反應,進而減少 TBK1 的 S-谷胱甘肽化(S-glutathionylation)。S-谷胱甘肽化的減少能使 TBK1 活性變得更好,同時也增加下游抗病毒的調控因子的生產。病毒的感染則會重置細胞內的谷氨酸代謝(Glutathione metabolism)機制,而沒被代謝掉的氧化態谷氨酸則會抑制 TBK1 的活性,並促進病毒複製。總合以上實驗結果,本篇作者認為,藉由 TBK1 的 S-谷胱甘肽化,可以為病毒調控的代謝及如何影響並躲避免疫系統的研究提供另一個研究方向。

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TDP-43 是一種在退化性神經疾病中常見的 RNA 結合蛋白,會沉積在細胞核或細胞質。本實驗團隊發現,神經退化引起的突變或轉譯後修飾的乙醯化會產生 RNA 結合功能缺陷的 TDP-43,使其解離成一種具有液體核心及外殼的球型結構。該研究團隊將此新發現的結構命名為:Anisosome,同時也發現此結構具有雙折射(birefringence)的特性,進一步證明其內部有液體存在。接下來該研究團隊導入數學模型推演,他們發現熱休克蛋白(Heat-Shock Protein,HSP)家族的 HSP70 是 anisosome 的液體核心中最主要的成分,可協助維持 anisosome 的結構。除了細胞實驗,該團隊也在小鼠身上投放蛋白酶體(Proteosome)抑制劑,去模擬因退化而變弱的蛋白酶體活性,發現當 ATP 減少時,會誘導 TDP-43 的 anisome 的型態產生。根據實驗結果,該團隊認為乙醯化、HSP70 以及蛋白酶體的活性都會參與調節 TDP-43 構型的轉換。

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油酸脂(Oleate)是一種在細胞內以及飲食中非常充足的順式非飽和性脂肪酸。其具有讓微管(microtubule)相關蛋白,例如 LC3,重新分佈到高基氏體反面網路(trans-Golgi network,TGN)的特性。該研究團隊透過全基因組篩選,發現有許多蛋白都跟高基氏體的運輸以及油酸鹽誘導的 LC3 的重新定位有關。此外,透過兩種檢測蛋白質分泌的方法:(i)利用熱敏性水皰性口腔炎病毒 G(VSVG)蛋白質檢測,使目標蛋白保
留在內質網(ER)中,直到溫度降低。(ii)等溫測定,為一可逆性實驗方法,可檢測目標蛋白在 ER 腔中滯留的情形;該團隊發現,油酸鹽會導致原本應該要被分泌出去的蛋白被保留在 TGN 內。接下來,該團隊透過藥理實驗尋找高基氏體中誘導 LC3 聚集的物質,發現油酸脂模擬物(Oleate mimetics)具有阻斷常規蛋白質分泌的能力。綜合以上實驗結果,該團隊認為油酸脂是一種作用於高基氏體,並會使 LC3 聚集而阻止蛋白質分泌的分子。

 

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