Twist抗體文庫消除抗體開發過程中DNA瓶頸

Twist抗體文庫消除抗體開發過程中DNA瓶頸

由倍思特生技 (ABreal) 代理的Twist Bioscience，在生技醫藥領域提供了可以精確表現設計序列的抗體變體文庫工具。

抗體開發流程的效率與進行篩選的DNA文庫品質有著直接的關聯。為了縮短開發的過程，研究人員需要一些工具，以進行更多的嘗試，並有效地針對這些可能性排列組合以製造更多的篩選機會。

現代的蛋白質展示技術能夠對合成抗體序列進行高通量測試。研究人員必須在單次實驗中篩選數十億個抗體變體，從而最大限度提高噬菌體展示流程中產生大量候選抗體的機會。因此，獲得抗體變體是抗體開發的重要先決條件。

DNA合成在抗體開發中的價值 (The value of DNA synthesis in antibody development)

抗體開發的兩個主要瓶頸都來源於DNA合成過程：

• 高品質且高通量篩選的能力—基本合成方法的品質直接決定了生成的抗體文庫的品質。文庫品質不佳會增加鑒定出滿意結果所需的篩選深度，且篩選重複或無用的序列會浪費寶貴資源。

• 將所有可能性正確排列組合的能力—研究機構往往滿足於為廣撒網而設計的文庫。然而，這種不適當的方法會伴隨著只鑒定出不良結合物以及實驗完全失敗的風險。

在這方面，高通量DNA合成技術的進步緩解了這些問題。Twist Bioscience公司的矽基DNA合成平臺採用微型化化學反應，並結合大幅提升的合成反應效率，可在單張矽晶片上生成超過100萬條高度均一的寡核苷酸。

圖1. NNK文庫以及Twist Bioscience的精確突變文庫在設計、構建上的比較。資料顯示，NNK文庫中20種胺基酸的平均觀察頻率偏離設計比例高達5.3%，且在每個位置約觀察到3%的終止密碼子。

精確合成的文庫讓研究人員可在合成前在電腦上預先設計和篩選每種抗體變體，進而減少下游製造成本以及無預期變化，包括提前終止密碼子、不需要的基序、異構化位點、切割位點、脫醯胺位點和醣基化位點。

抗體開發的未來 (The future of antibody discovery)

高通量的DNA合成消除了現代抗體開發過程中的幾個瓶頸。利用寡核苷酸合成的高品質、高通量合成文庫因具有優化的文庫性質和準確設計變異序列的能力，讓研究人員能夠進行更多嘗試並從中發現強效的候選抗體以解決研究課題。

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